Netflixov ' Nočni agent ' sledi Peter Sutherland na neznano ozemlje, ko prevzame plašč agenta Nočna akcija , agencija, katere obstoj so mu razkrili v prejšnji sezoni. Zadnjič je imel preprosto nalogo dvigniti telefon, ki nikoli ne bi smel zazvoniti. Vendar se njegovo življenje obrne na bolje ali slabše, ko zazvoni telefon. Na začetku druge sezone se Peter znajde globoko v misiji, ki naj bi izvlekla krta v FBI. Njegova naloga je odkriti, komu je krt posredoval informacije. To, kar naj bi bila preprosta misija, Peter in njegov partner naj ne bi počela nič drugega kot opazovati zaplete, Peter pa se spet znajde, da sprašuje vsako osebo, ki ji je kdaj zaupal.
Rose Larkin se pojavi, ko prejme klic neznane osebe in jo sprašuje o Petru. Več mesecev nista v stiku in ona postane zaskrbljena zanj. Da bi ga našla, uporablja AdVerse , aplikacija, za katero je delala, vendar njen pravi potencial še ni razkrit nikomur. Ko najde Petra, se zaplete v njegovo preiskavo, ki ga pripelje do Foxglove . Edina oseba, ki ji Peter in Rose lahko zaupata (pa ne brez začetnih zadržkov), je Catherine Weaver, ki verjame, da Peter ni pripravljen postati nočni agent. Trudi se mu zaupati, še posebej po kaj se je zgodilo z njegovim očetom , vendar se mora na koncu sprijazniti, da je on najboljša možnost, ki jo ima, zlasti glede na strašne okoliščine.
Do konca sezone se razkrije, da se načrtuje teroristični napad. Viktor Bala, diktator, ki prestaja kazen, potem ko je bil obtožen ubijanja lastnega ljudstva s smrtonosnim biološkim orožjem, je dal svoje najboljše može na delo, da povzročijo opustošenje v New Yorku, zlasti v ZN, z izpustitvijo KX, močnega kemičnega sredstva, ki vodi v grozljivo smrt svojih žrtev. Naloga je za vsako ceno ustaviti teroristični napad in Peter za to plača visoko ceno. SPOJLERI NAPREJ
Prva stvar, ki jo morata Peter in Catherine ugotoviti, je, kje se proizvaja KX. Vedo, da se je Markus, bratranec in glavni mož Viktorja Bale, nekje utaboril in ugrabil profesorja Wilfreda, ki je delal na Foxgloveu, da bi ustvaril kemično sredstvo. Rose je prav tako zadržana pri profesorju in edini razlog, da je doslej niso ubili, je ta, da Markus in njegovi ljudje mislijo, da je Wilfredova pomočnica. Rose in profesor izdelata nekaj serij kemikalije, ki je dovolj, da povzročita opustošenje v New Yorku, a sčasoma prideta do točke, ko se morata sprijazniti s tem, da bosta umrla, zato lahko načrtujeta pobeg .
Medtem ko Markusa ni, dvojica premeteno sprosti kemikalijo izven svojega laboratorija in pri tem ubije več oboroženih stražarjev. Ko se ponudi priložnost, skupaj z Wilfredovo ženo in hčerko pobegnejo iz laboratorija. Približno ob istem času tja prispe tudi Peter in vsi so rešeni. Kljub temu imajo Markus in njegovi možje še vedno dovolj KX, da opravijo delo. Težava je v tem, da nihče ne ve, kje nameravajo napasti. Rose razkrije, da jih je videla tihotapiti uniforme, ki se nanašajo na ZN, kar pomeni, da je stavba njihova glavna tarča. To je smiselno, ker se Viktor Bala zameri do njih, ker so ga spremenili v negativca, medtem ko so roke ZDA obrisane Foxglove in njihove vpletenosti v izdelavo in prodajo KX njemu.
Ekipo policistov pošljejo v stavbo ZN, kjer izsledijo čim več kanistrov KX. Hkrati jim Rose pomaga identificirati Markusa in njegove ljudi, ki so skoraj vsi aretirani ali ubiti. Na koncu so obračunani vsi razen enega kanistra, Markus pa je še vedno v vetru in lahko še vedno naredi veliko škode s katerimkoli KX-om, ki ga ima. Glede na to, da obstaja samo nekaj krajev, kamor lahko gre, se odločimo, da razdelimo ekipo in ga najdemo čim hitreje. Peter in Rose gresta za Sloane, dekletom Tomasa Bale, in seveda se izkaže, da je Markus tam.
Markusov načrt je bil odleteti, medtem ko zadnji kanister KX opravi svoje delo. Prihod Petra in Rose mu na pot postavi veliko oviro in Peter ga ustreli, potem ko je skušal Sloana uporabiti kot ščit. To še vedno pušča vprašanje o KX. Rose opazi serviserja, ki razkrije, da so poročali o težavah v zračnikih. Da bi odpravila svoj sum, sledi serviserju in izkaže se, da je Markus v zračnike vstavil kanister, ki bi se sprožil v trenutku, ko bi bila dosežena določena oznaka. Edini način, da zapreš zračnike, je, da začneš streljati znotraj enega od njih, in z le nekaj sekundami časa Rose in Peter prižgeta ogenj, ki sproži alarm, ki zapre vse zračnike, preden se KX lahko razširi in ubiti vsako osebo v hotelu.
Vse ima svojo ceno, zlasti informacije, in Peter pravi pomen takšnega posla ugotovi, ko se znajde v položaju, ki bi ogrozil njegovo etiko. Ko postane načrt Viktorja Bala glede KX jasen, Peter spozna, da je Rose v veliko večji nevarnosti in jo mora rešiti pred vsemi drugimi. Ona je edina oseba, ki mu je mar, zato je pripravljen storiti vse, da jo reši. Edina težava je, da rešiti njo pomeni obsoditi sebe. Jacob Monroe mu je pripravljen povedati, kje je Markus hranil Rose, a v zameno za to mu mora Peter ukrasti datoteko iz ZN. Ko bo to storjeno, bo Monroe odstranil vse dokaze o tem, da je bil Peter kdaj v stavbi ZN, vendar bo te dokaze obdržal zase in jih imel nad Petrovo glavo do konca svojega življenja.
Čeprav ve, da bi bil njegov celoten ugled in kariera uničen, če bi ukradel datoteko, Peter to vseeno stori, da bi rešil Rose. Šele veliko pozneje odkrije, kaj vsebuje datoteka in zakaj si jo je Monroe tako želela. Izkazalo se je, da je bil eden izmed kandidatov za predsednika ZDA nekoč šef Cie in je bil tisti, ki je vodil Foxglove in dal KX Viktorju Balaju, da je zagrešil pokol svojih ljudi. Ko je bil Bala aretiran zaradi vojnih zločinov, so ZN skrili dokaze o vpletenosti šefa Cie in za trenutek se je zdelo, da je vse skupaj za vedno pokopano. Njegov intervju med preiskavo primera so hranili v arhivu ZN in to je Peter dobil za Monroe.
Monroe je datoteko dala Haganu, drugemu glavnemu kandidatu za predsednika. S tako obsojajočim dokazom proti karakterju svojega tekmeca si Hagan ni mogel kaj, da ga ne bi izdal medijem. Ko je resnica o njegovi vpletenosti prišla na dan, je moral nekdanji šef Cie in obetavni predsednik umakniti svojo nominacijo, tako da je Hagan postal edina izbira za naslednjega predsednika ZDA. Do konca 2. sezone Hagan še ne bo prevzel funkcije, vendar je neizogibno. To tudi pomeni, da bo Jacob Monroe v veliko močnejšem položaju, kar Petru odpira vrata, da se odkupi.
V vročini je Peter moral sprejeti nekaj zelo težkih odločitev. Ni imel veliko časa za razmišljanje, kar je pomenilo, da je moral izbrati svoje prioritete, in takrat se ni nič zdelo pomembnejše od reševanja Rose. Ugrabil jo je Markus in bila je prisiljena narediti KX s profesorjem Wilfredom, čigar družina je bila ogrožena. Ker je ura tiktakala pred terorističnim napadom, za katerega je Peter vedel, da prihaja, ni imel veliko časa, da bi našel Rose in jo spravil iz nevarnosti. Torej je sklenil dogovor s hudičem. Na prvi pogled bi bilo videti kot enkraten posel, toda Peter je vedel, da bo, ko bo naredil uslugo Jacobu Monroeju, postal lastnik obveščevalnega posrednika.
Ko je teroristični napad onemogočen in je Rose živa in zdrava, se Peter odloči, da se bo vdal. Ve, da ne bi smel še naprej delati v Nočni akciji in Monroeju dati več informacij, da bi rešil svojo kožo. To bi bil grozen krog, iz katerega se ne bi mogel nikoli rešiti, zato se odloči priznati, čeprav ve, da bi to lahko pomenilo, da bo končal v zaporu. In to se nekaj časa dogaja. Glede na preteklost njegove družine, saj se je tudi njegov oče izkazal za krta, katerega dejanja so privedla do vdora v Pentagon, Petrovi nadrejeni niso tako navdušeni, da bi ga tako zlahka izpustili. Tedne preživi v celici, potem pa pade bomba.
Izkazalo se je, da je bil posnetek, ki ga je dal Monroeju, uporabljen za izločitev Haganove konkurence iz tekme in mu tako odprl pot v Belo hišo. To je hujše od vdora v Pentagon, ker pomeni, da je ogrožen sam predsednik, kar pomeni, da nobena državna skrivnost ni varna. Obupni časi zahtevajo obupne ukrepe in Catherine ve, da je edini način, da rešijo situacijo, če uporabijo Petra. Če bi imel Monroe svojega človeka v vladi, potem bi moral biti v njegovih vrstah vladni človek, ki bi vohunil za njim in uravnovešal tehtnico. Ker je Peter že pod Monroejevim nadzorom, ga nima smisla poslati v zapor.
Torej je Peter izpuščen pod pogojem, da služi kot dvojni agent. Monroe misli, da ima notranjega človeka v Night Action, edini agenciji, ki je bila tako dolgo izven njegovega dosega. Vendar le Catherine in nekaj drugih ljudi ve, da se bo Peter dejansko infiltriral v njegovo celotno operacijo in izločil vse, ki so na skrivaj delali zanj. To je edini način, da zagotovijo, da bodo vsi slabi fantje izginili iz vladnega sistema, vsaj tisti, ki delajo za Monroe, in da se bo država lahko rešila pred razprodajo tistemu, ki bo ponudil največ.